Fluorescens i situ-hybridisering
Fluorescens in situ hybridisering (FISH) er en af flere teknikker, der bruges til at søge i din celles DNA, på udkig efter forekomst eller fravær af specifikke gener eller dele af gener.
Mange forskellige typer kræft er forbundet med kendte genetiske abnormiteter. Og ved genetisk taler vi ikke kun om arvelighed. Over en levetid kan celler lave fejl, når de deler og vokser.
Mutationer i DNA'et, der er forbundet med cancer, kan akkumulere i disse celler.
Hvordan virker FISH?
FISH er en teknik, der bruger fluorescerende prober til at detektere specifikke gener eller dele af gener (DNA-sekvenser). Medicinsk centerlaboratorier og onkologer bruger FISH til at hjælpe med at vurdere patienter, der kan have kræft, og til tider at overvåge en patient, der allerede har været diagnosticeret med kræft og behandlet.
FISH kan udføres ved hjælp af forskellige typer af prøver i henhold til lokaliteten og typen af kræftform: Tumorceller opnået fra perifert blod, fra en knoglemarvsbiopsi eller fra en lymfeknudebiopsi og formalin-fast paraffinindlejret væv (dette refererer til en prøve af væv, der behandles i laboratoriet og indlejret i en slags voks, hvilket gør den mere stiv, så den kan skives i tynde sektioner og monteret til visning under mikroskopet).
Hvad betyder bogstaverne?
"H" i FISH refererer til hybridisering.
Ved molekylær hybridisering anvendes en mærket DNA eller RNA-sekvens som en sonde - visualiser en rød Lego mursten, hvis du vil. Sonden bruges til at finde en modstykke Lego mursten, eller DNA-sekvens, i en biologisk prøve.
DNA i din prøve er som bunker af Lego mursten, og de fleste mursten i disse bunker stemmer ikke overens med vores røde sonde.
Og alle dine mursten er pænt organiseret i 23 par murstensbunker - hver bunke er mere eller mindre en af dine parrede homologe kromosomer. I modsætning til Lego-klodser er vores røde Lego-probe ligesom en stærk magnet og finder sin kamp uden at skulle sortere gennem haugerne.
"F" refererer til fluorescens. Vores røde sonde kan gå tabt i bunkerne af mursten, så den er mærket med farvet fluorescerende farvestof, så det vil lyse. Når det finder sin match blandt de 23 parrede bunker, afslører et fluorescerende tag sin placering. Så nu kan du se, hvordan forskere og klinikere kan bruge FISH til at hjælpe med at identificere hvor (hvilken bunke eller hvilket kromosom) et bestemt gen er placeret for et givet individ.
"I" og "S" står for in situ . Dette refererer til det faktum, at vores røde Lego mursten leder efter sin kamp inden for den stikprøve, du gav .
Hvad med specifikke blodkankere?
FISH og andre in situ hybridiseringsprocedurer anvendes til at diagnosticere en række kromosomale abnormiteter - ændringer i det genetiske materiale, ændringer i kromosomer, herunder følgende:
Sletning - en del af et kromosom er væk
Translocation - en del af et kromosom bryder af og stikker på et andet kromosom
Inversion - en del af et kromosom slukkes og genindsættes tilbage, men i omvendt rækkefølge
Duplikation - en del af et kromosom er til stede i for mange kopier i cellen
Hver type kræft kan have sit eget sæt kromosomale forandringer og relevante prober. FISH hjælper ikke kun med at identificere de oprindelige genetiske ændringer i en sygdomsproces som kræft, men det kan også bruges til at overvåge respons på terapi og sygdomsreduktion.
De genetiske ændringer, som FISH opdager, giver nogle gange yderligere information om, hvordan en persons kræft sandsynligvis opfører sig, baseret på det, der tidligere er blevet observeret hos mennesker med samme type kræft og lignende genetiske forandringer. Nogle gange anvendes FISH efter diagnosen allerede er lavet for at opsamle yderligere oplysninger, der kan hjælpe med at forudsige patientens resultat eller bedste behandling.
FISH kan identificere kromosomale abnormiteter i leukæmier , herunder i kronisk lymfocytisk leukæmi (CLL). Til kronisk lymfocytisk leukæmi / lille lymfocytisk lymfom giver FISH patienterne mulighed for at finde ud af deres prognostiske kategori: god, mellemliggende eller fattige. Ved akut lymfoblastisk leukæmi (ALL) kan de leukæmiske cellers genetik fortælle dig om risikoeniveauet for kræft og hjælpe med at styre terapeutiske beslutninger.
FISH-paneler er også tilgængelige for lymfom, multiple myelom, plasmacelleproliferative forstyrrelser og myelodysplastisk syndrom. I tilfælde af mantelcellelymfom er der for eksempel en translokation, som FISH kan detektere kaldet GH / CCND1 t (11; 14), der ofte er forbundet med dette lymfom.
Hvorfor FISH?
En fordel ved FISH er, at den ikke behøver at udføres på celler, som aktivt deles. Cytogenetisk afprøvning tager normalt cirka tre uger, fordi kræftcellerne skal vokse i laboratorieskål i ca. 2 uger, før de kan testes. I modsætning hertil er FISH-resultater normalt tilgængelige fra laboratoriet inden for få dage.
> Kilder:
> Cancer Cytogenetisk Testing CPT-koder.
> Fluorescens i situ-hybridisering (FISH). http://www.genome.gov/10000206#al-2.
> Fluorescens i situ-hybridisering (FISH). http://www.nature.com/scitable/topicpage/fluorescence-in-situ-hybridization-fish-327.
> Wolff DJ, Bagg A, Cooley LD, et al. Vejledning til fluorescens i situ Hybridiseringstest i hæmatologiske lidelser. Journal of Molecular Diagnostics: JMD. 2007; 9 (2): 134-143.