Få mere at vide om Paenibacillus-stammen VT 400
I sommeren 2016, på det årlige møde i American Society for Microbiology, samledes forskere til at dele og diskutere resultater relateret til bakterier og menneskers sundhed.
Blandt opdagelserne rapporterede en gruppe om hele genomet eller det komplette sæt gener til en bakterie kaldet Paenibacillus species stamme VT 400 (PVT400). Disse bakterier var tidligere blevet fundet i spyt af en pædiatrisk patient med akut lymfoblastisk leukæmi (ALL).
De detaljerede oplysninger fra denne og fremtidige undersøgelser vil hjælpe forskere med at lære om, hvorvidt disse bakterier kan have en rolle i menneskers sygdom, især hos personer med akut leukæmi, som udvikler lungebetændelse eller infektioner i blodet.
Lungebetændelse hos mennesker med kræft
Lungebetændelse er den største dødsårsag hos kræftpatienter med neutropeni, og især dem med akut leukæmi. Neutropeni er et lavt antal neutrofiler i blodneutrofilerne er hvide blodlegemer, der er vigtige for at hjælpe kroppen med at bekæmpe infektion .
Nedre luftvejsinfektioner er meget almindelige blandt kræftpatienter, hvor nogle rapporter viser, at 13 til 31 procent af leukæmipatienter, der modtager kemoterapi, og op til 80 procent af hæmatopoietiske stamcelle-transplantationsmodtagere vil opleve mindst en episode af lungebetændelse.
Neutropenisk lungebetændelse er potentielt livstruende infektioner. I sådanne scenarier starter lægerne straks antibiotikabehandling uden at vente på laboratorieresultater for at bekræfte og specificere typen af bakterieinfektion - fordi det er så vigtigt at starte behandlingen på en gang for at reducere risikoen for, at patienten vil bøje for infektionen.
Faktisk anvendes forebyggende terapi under visse omstændigheder, som er detaljeret nedenfor.
Nylige fremskridt i forvaltningen af neutropenisk lungebetændelse er et håb om bedre resultater. Flere medicinske samfund har udgivet opdaterede retningslinjer for antibiotikabehandling af mistænkt neutropenisk lungebetændelse.
Og det er muligt, at nyere agenter, der fremmer kroppens reaktioner på infektion, yderligere kan forbedre antibiotikernes aktivitet.
Fokus på patogenerne hos patienter med neutropeni
Retningslinjer fra American Society of Clinical Oncology (ASCO) anbefaler, at læger forsøger at forhindre infektion hos ambulante patienter med dyb neutropeni, men ingen feber. Antibakteriel og antifungal behandling anbefales, hvis neutrofile forventes at forblive under 100 μl i mere end syv dage. Retningslinjerne angiver, at det foretrukne middel til antibakteriel forebyggende terapi er en oral fluoroquinolon, mens den til antifungal behandling er en oral triazol.
Patienter med neutropeni er modtagelige for en meget bredere vifte af patogener end deres modstykker. Det kan være nyttigt for lægerne at overveje, hvor bakterierne stammer fra ved at forudsige hvilke antibiotika de sandsynligvis vil være resistente over for, og hvilke strategier der sandsynligvis vil være mest effektive.
Paenibacillus Species
I den forbindelse har forskere studeret PVT400, de nye bakterier isoleret fra leukemipatienten, medlem af Paenibacillus-slægten - en familie af stavformede bakteriearter. Forskellige arter inden for denne gruppe er blevet isoleret fra jord, vand, planter, mælk og andre steder.
Imidlertid var ikke Paenibacillus-arter kendt for at forårsage menneskers sygdom. .. indtil de seneste rapporter viste den mulige inddragelse af tre forskellige Paenibacillus arter i menneskelige sygdomme.
Efter at PVT 400 var isoleret fra spyt af en pædiatrisk patient med akut lymfoblastisk leukæmi , viste tidlige undersøgelser en vis lighed mellem disse isolater med amylolyticus-arterne, som findes i flygelens larverhindgut; Hidtil er det stadig sandt, at P. amylolyticus ikke er blevet detekteret hos mennesker, og yderligere undersøgelser viste forskelle mellem stamme-VT 400 bakterier fundet i kræftpatienten og andre P.
amylolyticus stammer.
Så da forskere studerede hele VT 400-genomet, var der en række interessante fund. Det havde gener kodende modstandsmekanismer til kemoterapeutiske lægemidler, som tunicamycin og bleomycin. De fandt også gener for bakteriepumper, der er associeret med multidrugresistens, såvel som gener, der koder for resistens overfor antibiotika, herunder vancomycin, fosmidomycin, tetracyclin samt penicillinlignende stoffer eller beta-lactamerne.
Forfatterne af dette genomstudium bemærkede, at den fuldstændige genomsekvens af Paenibacillus sp. stamme VT 400 vil hjælpe med at bestemme Paenibacillus-arternes rolle i humane sygdomme og give indsigt i sammensætningen af de normale bakterier, der lever hos patienter med blodkræft.
Kilder:
> Evans SE, Ost DE. Lungebetændelse i den neutropeniske kræftpatient. Curr Opin Pulm Med . 2015; 21 (3): 260-271.
Rybakova D, Wetzlinger U, Müller H, et al. Komplet genom-sekvens af Paenibacillus polymyxa stamme SB3-1, en jordbåren bakterie med antagonistisk aktivitet mod plantepatogener. Genome Meddelelse . 2015; 3 (2): e00052-15.
De Souza R, Sant'Anna FH, Ambrosini A, et al. Genoom af Pseudomonas sp. FeS53a, en formodet plantevækstfremmende bakterie forbundet med ris dyrket i jernbelastede jordarter. Genome Meddelelse. 2015 (2): e00248-15. 10,1128 / genomeA.00248-15.
Spence R, Demchick P, Hornitzky M, et al. Overvågning af New Zealand apiaries for Paenibacillus alvei. NZ Entomol . 2013; 36: 82-86.
Kim KK, Lee KC, Yu H, et al. Paenibacillus sputi sp. nov., isoleret fra sputum hos en patient med lungesygdom. Int J Syst Evol Microbiol . 2010; 60: 2371-2376.
Mulcahy N. Ny ASCO retningslinje om neutropeni og feber. Medscape Medical News. 16. januar 2013. Tilgængelig på http://www.medscape.com/viewarticle/777736.
Blomster CR, Seidenfeld J, Bow EJ, et al. Antimikrobiell profylakse og ambulant behandling af feber og neutropeni hos voksne behandlet for malignitet: American Society of Clinical Oncology Clinical Practice Guideline . J Clin Oncol . 2013; 31 (6): 794-810.